MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Treponema azotonutricium ZAS-9 chromosome

Total Repeats: 7478

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015577	GGC	2	6	16	21	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015577	A	6	6	85	90	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015577	TATAA	2	10	143	152	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015577	TA	3	6	1738	1743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015577	ATAA	2	8	1758	1765	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015577	TAC	2	6	1901	1906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015577	TA	5	10	1917	1926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015577	TAT	2	6	10692	10697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015577	AGG	2	6	15340	15345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015577	T	8	8	16259	16266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015577	GCCT	2	8	20136	20143	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_015577	TAT	2	6	21200	21205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015577	CCG	2	6	21235	21240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_015577	TGA	2	6	24860	24865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015577	ATA	2	6	25080	25085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015577	TAT	2	6	25142	25147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015577	AT	3	6	25146	25151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015577	GGA	2	6	25157	25162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015577	ATA	2	6	29525	29530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015577	AC	3	6	31832	31837	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_015577	A	6	6	31864	31869	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015577	C	6	6	31880	31885	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
23	NC_015577	CTC	2	6	31903	31908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_015577	TCG	2	6	31917	31922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_015577	C	6	6	31941	31946	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_015577	T	7	7	31950	31956	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015577	AGG	2	6	31971	31976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015577	ACC	2	6	32015	32020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_015577	AT	3	6	32032	32037	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015577	TAA	2	6	32090	32095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015577	AAT	2	6	32492	32497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015577	A	6	6	32515	32520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015577	CCT	2	6	32569	32574	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_015577	TCC	2	6	32579	32584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_015577	TTGA	2	8	32592	32599	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015577	GGATAA	2	12	32640	32651	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015577	TTGCG	2	10	33064	33073	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_015577	ATTT	2	8	33100	33107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015577	ACT	2	6	33115	33120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_015577	CTTAA	2	10	33161	33170	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_015577	AGGA	2	8	33177	33184	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015577	TCC	2	6	38409	38414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_015577	CTT	2	6	38451	38456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015577	TA	3	6	38669	38674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015577	TGTA	2	8	38868	38875	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015577	TAG	2	6	38893	38898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015577	TCA	2	6	38946	38951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_015577	A	6	6	38995	39000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015577	TAA	2	6	39127	39132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015577	AAT	2	6	39167	39172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015577	TCC	2	6	39179	39184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_015577	AAT	2	6	40329	40334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015577	TCCT	2	8	46723	46730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_015577	GAG	2	6	46748	46753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015577	CGG	2	6	47575	47580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015577	GA	3	6	47610	47615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015577	GAC	2	6	50909	50914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015577	GTC	2	6	50972	50977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_015577	T	8	8	51013	51020	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015577	T	7	7	51022	51028	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015577	T	8	8	51032	51039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015577	ATG	2	6	51056	51061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015577	TAA	2	6	51102	51107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015577	TAC	2	6	51125	51130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_015577	CTG	2	6	52402	52407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_015577	TTGC	2	8	52414	52421	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_015577	TCC	2	6	52423	52428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_015577	CTTCC	2	10	52454	52463	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
69	NC_015577	T	6	6	55134	55139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015577	GAA	2	6	55147	55152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015577	CCG	2	6	55158	55163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_015577	TTG	2	6	57557	57562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015577	AT	3	6	57565	57570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015577	TAA	2	6	57571	57576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015577	ATG	2	6	57615	57620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015577	GAA	2	6	57636	57641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015577	T	6	6	57644	57649	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015577	ATG	2	6	57656	57661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015577	AT	3	6	60444	60449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015577	AAG	2	6	60481	60486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015577	C	6	6	60524	60529	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
82	NC_015577	ACTG	2	8	60580	60587	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_015577	CCA	2	6	60668	60673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_015577	GGC	2	6	60700	60705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015577	CCCA	2	8	60739	60746	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_015577	GCG	2	6	60779	60784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_015577	CT	3	6	60800	60805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_015577	CGA	2	6	60912	60917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015577	TGA	2	6	60933	60938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015577	CAT	2	6	61035	61040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_015577	GCA	2	6	61057	61062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_015577	TAT	2	6	61104	61109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015577	ATG	2	6	61222	61227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015577	AAG	2	6	61301	61306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015577	T	6	6	61310	61315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015577	GGA	2	6	62825	62830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015577	AAAT	2	8	66023	66030	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015577	TTG	2	6	66065	66070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015577	TAT	2	6	66112	66117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015577	AGG	2	6	66120	66125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015577	CCT	2	6	70792	70797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_015577	AGC	2	6	70873	70878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015577	TGC	2	6	70882	70887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_015577	T	7	7	71432	71438	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015577	GGT	2	6	71471	71476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015577	TTG	2	6	71483	71488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015577	CTC	3	9	71546	71554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_015577	T	6	6	71566	71571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015577	TTC	2	6	73602	73607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_015577	T	6	6	73627	73632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015577	T	6	6	73696	73701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015577	A	7	7	73745	73751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015577	AAT	2	6	75287	75292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015577	AGT	2	6	75325	75330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015577	ATT	2	6	75404	75409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015577	ATCA	2	8	75440	75447	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_015577	A	7	7	76179	76185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015577	TAT	2	6	76205	76210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015577	ACA	2	6	76233	76238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_015577	ATT	2	6	76292	76297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015577	CAT	2	6	76317	76322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015577	A	6	6	76329	76334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015577	ACC	2	6	76614	76619	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_015577	TAA	3	9	76621	76629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015577	AT	3	6	76630	76635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015577	T	6	6	76673	76678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015577	CTT	2	6	76681	76686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015577	ATT	2	6	76703	76708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015577	G	6	6	76717	76722	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015577	AGG	2	6	76748	76753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015577	G	6	6	76758	76763	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015577	AGT	2	6	76764	76769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015577	TGA	2	6	76792	76797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015577	T	6	6	77589	77594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015577	TAA	2	6	79390	79395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015577	AGC	2	6	80572	80577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015577	GTT	3	9	80581	80589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015577	GAA	2	6	92542	92547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015577	T	7	7	92808	92814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015577	TTG	2	6	92837	92842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015577	GCC	2	6	92981	92986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_015577	GTT	2	6	92991	92996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015577	CCT	2	6	94175	94180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_015577	AT	3	6	94195	94200	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015577	TTAG	2	8	94201	94208	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015577	T	6	6	94273	94278	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015577	TC	3	6	95821	95826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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150	NC_015577	AT	3	6	96626	96631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015577	C	7	7	96651	96657	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
152	NC_015577	CTG	2	6	99635	99640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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186	NC_015577	T	6	6	124780	124785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_015577	AGA	2	6	342936	342941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_015577	CGG	2	6	352064	352069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
452	NC_015577	ATGGT	2	10	352103	352112	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
453	NC_015577	ATA	2	6	352114	352119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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455	NC_015577	CGG	2	6	353541	353546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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